O Barreiro da Faneca é uma das zonas abrangidas pelo PRECEFIAS - Plano Regional de Erradicação e Controlo de Espécies de Flora Invasora em Áreas Sensíveis. A acção de limpeza nos cerca de 12 000 m2 já decorre, está orçamentada em 55 000,00 € e é da responsabilidade da Secretaria Regional do Ambiente e do Mar.
As espécies de flora invasora que estão a ser erradicadas são o Pittosporum Undulatum(incenso), Ulex Europaeus(Pica rato, Tojo), Pinus Pinaster(Pinheiro Bravo) e o Pteridium Aquilinum(Feto)